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任仙文

联系方式:renxwise@cpl.ac.cn


教育经历


2007-2010   中国科学院数学与系统科学研究院,运筹学与控制论,博士 
2004-2007   中国人民解放军军事医学科学院生物工程研究所,遗传学,硕士

2000-2004   南开大学,生物科学、信息与计算科学,双学位

 

工作经历


2016-2021   北京大学,生物医学前沿创新中心(BIOPIC),副研究员

2013-2016   中国医学科学院北京协和医学院病原生物学研究所,副研究员,硕导

2010-2013   中国医学科学院北京协和医学院病原生物学研究所,助理研究员

2008-2009   康奈尔大学外尔医学院卫斯理医院研究所,访问学生


研究简介


单细胞生物信息学,计算免疫学


主要荣誉


2022   中源协和创新突破奖

2020   国家自然科学基金委优秀青年

2020   北京市自然科学一等奖

2016   高等学校优秀科学技术成果奖技进步一等奖

2014   中国医学科学院北京协和医学院“协和新星”


代表性成果


1. Single-cell RNA sequencing reveals intrahepatic and peripheral immune characteristics related to disease phases in HBV-infected patients. Gut, 2023


2. Immune phenotypic linkage between colorectal cancer and liver metastasis. Cancer Cell, 2022


3. COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas. Cell, 2021


4. Reconstruction of cell spatial organization from single-cell RNA sequencing data based on ligand-receptor mediated self-assembly, Cell Research, 2020


5. Landscape and dynamics of single immune cells in hepatocellular carcinoma. Cell, 2019