2025年4月15日,昌平实验室科学家陈明辰主持召开人工智能与前沿技术部学术讲座,本次讲座邀请到中国科学院上海药物研究所陆晓杰研究员进行了题为“DNA-encoded Focused Library Accelerates the Drug Discovery”的学术报告,分享了核酸编码化合物库(DNA Encoded Library, DEL)技术用于新靶点创新药物发现的研究进展。
学部科学家陈明辰主持
陆晓杰现任中国科学院上海药物研究所研究员。陆晓杰研究员主要研究方向为将核酸编码化合库筛选技术和其他药物开发技术(计算机辅助药物设计,天然产物药物开发等)相结合,设计并合成针对特定靶点的核酸编码集中库来加快小分子、环肽和核酸药物的开发。
陆晓杰研究员分享报告
讲座背景:
核酸编码化合物库(DNA Encoded Library, DEL)是一种用于对疾病相关的生物靶点进行亲合筛选来发现小分子和环肽先导化合物的有力工具。DEL技术已广泛被制药工业界用于促进新靶点配体分子的发现,此外DEL技术也可以和其他药物技术结合起来进一步加快药物开发。
讲座内容:
陆晓杰研究员系统性汇报了DEL技术和其他药物发现技术的交叉应用,例如基于结构和片断的药物设计、共价药物、人工智能技术、换台药物和Protac降解技术等。利用多种技术交叉融合的DEL集中库技术促进新靶点的创新药物发现。
之后,陆研究员详细讲解了共价DEL技术(CoDEL)的方案与应用实例。通过在适当位置加入反应弹头,可逆配体可被合理设计成共价抑制剂。陆晓杰团队利用该技术成功实现对新冠非结构蛋白(NSP)抑制剂筛选;开发基于活性的蛋白质组分析技术并应用该方法为一系列蛋白找到了靶向酪氨酸的共价苗头化合物。与CoDEL结合的技术方案,用于共价苗头化合物的发现等。
最后,陆研究员分享了其团队在DEL与AI融合方向的思考与进展。陆研究员团队使用DEL库筛选结果做为预训练数据,训练AI模型进行虚拟筛选。例如团队以BRD4、p300等特点靶点验证模型能力,结果表明,通过DEL筛选数据训练建立的AI模型,并利用模型鉴定的活性化合物具有结构新颖和多样化的特征。DEL技术与AI的结合,为药物发现开辟了全新的、具有吸引力的研究方向。
科研人员提问与交流
陆晓杰研究员此次讲座吸引了人工智能大分子设计及相关领域科学家、科研人员及学生参会。在讲座内容结束后,陆研究员与参会人员就DEL建库规模与影响、如何使用人工智能结合DEL建库实现分子筛选、DEL技术的未来发展方向等方面展开了热烈讨论。
昌平实验室开展学术讲座系列活动,邀请知名学者专家开展专题讲座,努力打造特色化、专业化、品牌化学术交流活动,为打造世界一流生命科学创新高地提供良好学术平台。